至1945年是东北抗日联军开展小型游击战和转入苏联整训时期。

东北抗日联军成立之后，强有力地打击了日本侵略者，动摇了侵略者的大后方，日本侵略者不得不调集大批部队一次又一次进行疯狂地“讨伐”，实施“三年治安肃正计划”；加之抗日联军与上级党组织失去了联系，地方党组织遭到毁灭性破坏，山上密营损失殆尽，粮食、药品、盐等给养完全断绝，许多优秀的指战员壮烈牺牲，部队损失惨重。从1939年到1940年，东北抗日联军的游击战争转入极端艰苦的斗争阶段。但是东北抗日联军的意志没有被打垮，抗联部队缩编，开展小型游击战争，保存了一部分精华和骨干力量，进入苏联境内整训。在苏联整训期间不断派小部队深入中国抗联游击区进行游击战，直到1945年8月，他们配合苏军重新进入东北，在解放东北的斗争中起到了重要作用。

****对东北抗日联军的艰苦斗争给予了很高的评价，1938年11月，中国**扩大的六届六中全会给东北同胞的电文中称赞东北抗日军队是:“在冰天雪地与敌周旋7年多的不怕困苦艰难奋斗之模范。”

1948年1月1日，****东北局曾专门做出决定，表彰东北抗日联军的历史功绩，称赞东北抗日联军的英勇斗争“是中国**光荣历史不可分割的一部分”。1949年5月，****给东北局的电文中再次指出抗联斗争是光荣的，称“此种光荣历史应受到党的承认和尊重。”

东北抗日联军名义上是**领导的抗日队伍，实际上和延安没有直接军事联系，是在苏联支持下的抗日队伍，越过**直接受共产国际战略领导。游击队军服是模仿苏联红军军服。

其中东北抗日联军有不少**人。战后，在苏联帮助下，他们组建了**劳动党。****主义人民共和国的第一代领导人（金日成、崔庸健）多为东北抗日联军中层军官。